從2005年立院通過預算後，工程就如火如荼的展開，雖然沒有趕上高鐵通車的時程，不過也終於趕在建國百年的時程通車，原本要以捷運系統興建，但是由於政府財政吃緊，為了節省預算，最後由高鐵局提出了興建銜接台鐵的沙崙支線的構想，因為所需經費少，所以最後定案，並進行初步設計，之後全案由鐵路改建工程局負責後續工程，由於該支線的通車，也使得南科站經台南中洲到沙崙站這一段區間列車密集度提升，也是這一區段台鐵捷運化的開始！未來還會增設三座通勤站分別是仁德站、台南航空站（南台南）、文化中心站，其中我要是沒記錯的話，仁德站已經再施工了，我想兩年內應該也會完工啓用了！
之前還未完工時，有到此來看看工程進度，當時月台已經有雛形出來了，整個車站完工後，果然讓人耳目一新，而中洲站也因為興建沙崙支線得關係，整個大翻修，整體對於旅客的服務性大大提升！
新的列車資訊看板，大膽啓用白色的底色，跟一般的車站得藍色調大大的不相同！
通過中洲站南下自強號！
北上往南科站的區間車準備進站！
目前使用魚沙崙支線的車型是EMU600型，這型車早期是配在新竹機務段，目前已經改配嘉義機務段，其中EMU610~614為沙崙線得專用車，並且車體做了一番彩繪，使外型非常搶眼！
討厭的欄杆，壞了我的照片，這個是七股黑面琵鷺！
台南關子嶺溫泉圖裝
台南賞花車身
台江國家公園圖裝
中洲站內高鐵乘車資訊，也就是及時的時刻表，這是很大的進步，這對於要轉搭高鐵的旅客會非常的方便，更容易掌握自己後續的行程！
目前整個工程後續還在收尾中！
過去只有大站才擁有的顯示器，及時的列車資訊，這個連高雄站都沒有！
新的中洲站體
可惜的是一出車站外並沒有甚麼空間，聯外道路也很小，搭這麼大的站體有點突兀！
新的閘口！右邊為新的驗票閘門，聽說造價並不便宜，不過卻可以使用一卡通、台灣卡、悠遊卡甚至ETC等等！
新的站房
原本的舊站早已經被夷為平地了
往沙崙的列車進站
經過改裝的EMU600型，列車提供了跟日本山手線一樣的顯示資訊！
不但會顯示列車的車內資訊，還會撥報顯示下一站的訊息，這跟過去只是用LED跑馬燈的方式又更加進步了！不知道這個有沒有機會大量的被採用到其他列車上！
首度以高架的方式橫跨中山高速公路！
由於1/15以前免費搭乘，所以有很多旅客是跟我一樣來試搭的！
首座以學校命名的台鐵車站
也有不少旅客在此下車
列車開始靠近沙崙站
抵達沙崙站
高鐵台南站
已經更新為LED顯示器
台鐵月台與高鐵相望，雖然有點距離，不過仍然能感受到高鐵列車過站不停的震撼！
台鐵少有的終端式車站
停車待開
往高鐵車站的連絡道
EMU600彩繪車
台鐵沙崙站外觀
未來連絡高鐵到台南市區會因為這條支線的通車而更方便，畢進火車的可靠度還是比一般公路汽車客運來的要好，而且未來新設的通勤車站陸續完工後，相信這條路線會更為方便，雖然目前列車行駛區間只有三種，分別為沙崙～台南、沙崙～台南～南科、沙崙～嘉義區間， 列車間隔約為三十分一班車，不過因為是定型化時刻表，所以便利性也不小！建議未來至南科站的列車可以延駛至善化站，因為南科站沒有橫渡線，所以目前列車到達南科站後是以回送的方式至善化站，再回沙崙，但因為目前善化站只有一座島式月台，列車容量不足，所以當地民眾只能望車興嘆了，我想這也只能靠台鐵想辦法去改善了！不管如何，這條新的支線完成，串起了台南地區兩條鐵道幹線，方便了南來北往得旅客，也期望未來交通建設，或許可以考慮以此方式，取代昂貴的捷運，讓台鐵更便捷化，這對於到處吵著要興建高運量捷運的地方政府，或許會是個借鏡！
